- Участие в разработке проектов целевых программ в области мелиорации земель, повышение технического уровня действующих мелиоративных систем, отдельно расположенных гидротехнических сооружений и объектов сельскохозяйственного водоснабжения;

- реализация в установленном порядке федеральных целевых программ в соответствии с законодательством Российской Федерации на территории Саратовской области;

- координация деятельности всех находящихся на территории Саратовской области организаций (независимо от их организационно-правовой формы), осуществляющих работы по реализации целевых программ в соответствии с законодательством Российской Федерации (проектирование, строительство, реконструкция, ремонт, эксплуатация мелиоративных систем и отдельно расположенных гидротехнических сооружений), по которым Учреждение выступает государственным заказчиком (заказчиком-застройщиком), а также другим направлениям деятельности по обеспечению плодородия земель сельскохозяйственного назначения в рамках реализации целевых программ;

- проверка хода и качества проведения мелиоративных и других мероприятий в области обеспечения плодородия земель при осуществлении Учреждением функции заказчика по реализации целевых программ в соответствии с законодательством Российской Федерации;

- участие в установленном порядке в проверке соблюдения правил эксплуатации и состояния мелиоративных систем и отдельно расположенных гидротехнических сооружений, организации учета и проведения мониторинга мелиорированных земель, паспортизации мелиоративных систем и отдельно расположенных гидротехнических сооружений, составлении сводного мелиоративного кадастра и итогов паспортизации оросительных и осушительных систем в целом по Саратовской области;

- участие в установленном порядке в организации учета показателей плодородия земель сельскохозяйственного назначения, сборе и обобщении  информации о состоянии плодородия земель сельскохозяйственного назначения;

- выработка рекомендаций по проведению мелиоративных, противоэрозионных и других мероприятий в области обеспечения плодородия земель сельскохозяйственного назначения и представление их в Минсельхоз России для составления проектов федеральных целевых программ в области мелиорации и повышения плодородия почв;

- выполнение в установленном порядке функций государственного заказчика (заказчика-застройщика) по объектам строительства в области мелиорации земель, сельскохозяйственного водоснабжения и социального развития села за счет средств федерального бюджета в соответствии с целями деятельности Учреждения;

- организация в установленном порядке приемки законченных строительством объектов, возводимых в рамках реализации федеральных целевых программ при выполнении функций государственного заказчика в соответствии с законодательством Российской Федерации;

- организация технической эксплуатации государственных мелиоративных систем и отдельно расположенных гидротехнических сооружений, объектов сельскохозяйственного водоснабжения и другого государственного имущества, переданного Учреждению в оперативное управление;

- внесение предложений в Минсельхоз России по распределению средств, выделяемых из федерального бюджета на содержание и ремонт мелиоративных систем, отдельно расположенных гидротехнических сооружений, находящихся в федеральной собственности, проведение сельскохозяйственных мелиорации, противопаводковые и другие мелиоративные мероприятия;

- внесение предложений в пределах компетенции при установлении Министерством природных ресурсов Российской Федерации или органом государственной власти субъекта Российской Федерации лимитов водопотребления и водоотведения по изъятию воды из водного объекта и сбросу сточных вод нормативного качества в водные объекты;

- участие в установленном порядке в распределении водных ресурсов, забираемых из водных объектов для нужд мелиорации земель и сельскохозяйственного водоснабжения;

- участие в установленном порядке в обеспечении соблюдения нормативов, стандартов и требований по охране окружающей среды при проведении мелиоративных мероприятий;

- участие в установленном порядке в проведении работ по предупреждению и ликвидации последствий стихийных бедствий и чрезвычайных ситуаций на мелиоративных системах и отдельно расположенных гидротехнических сооружениях;

- обеспечение безопасности гидротехнических сооружений, находящихся в федеральной собственности и переданных Учреждению в оперативное управление, в соответствии с требованиями Федерального закона «О безопасности гидротехнических сооружений»;

- проведение пропаганды передовых технологий и методов ведения работ в области мелиорации земель;

- консультирование представителей органов государственной власти и органов местного самоуправления по вопросам, связанным с мелиорацией земель;

- размещение в порядке, установленном законодательством Российской Федерации, заказов на поставку товаров, выполнение работ, оказание услуг для государственных нужд и заключение государственных контрактов за счет средств бюджета в том числе по которым Учреждение выступает государственным заказчиком (заказчиком-застройщиком).